Uczelniane Centrum Kształcenia na Odległość realizuje również projekty innowacyjne. Największym jak do tej pory przedsięwzięciem w całości koordynowanym przez Centrum był projekt Wirtualna Fizyka - Wiedza Prawdziwa, mający na celu zachęcenie młodzieży do studiowania kierunków technicznych i zniwelowanie mylnych przekonań nt. fizyki jako przedmiotu nudnego i trudnego (więcej informacji o projekcie), (ewaluacja projektu).
Projekt realizowany był przy współpracy z Ministerstwem Edukacji Narodowej, a jego wartość przewyższała 5 mln. złotych. Innowacyjne materiały edukacyjne trafiły do ponad 220 szkół Ponadgimnazjalnych z całej Polski, a projekt znalazł się na liście najlepszych projektów edukacyjnych realizowanych za pieniądze UE oraz zajął 4 miejsce na liście rankingowej Liderów Innowacji i Współpracy Ponadnarodowej PO KL 2007-2013.
UCKnO uczestniczyło również w innych projektach finansowanych ze środków Unii Europejskiej, realizowanych przez Politechnikę Koszalińską, były to między innym
- Zachodniopomorski Informator Szkoleniowy
- Program rozwojowy Politechniki Koszalińskiej w zakresie kształcenia na kierunkach technicznych
- Rozbudowa kampusu Politechniki Koszalińskiej przy ul. Śniadeckich.